许多（粪）有机肥料带有病菌、虫卵和杂草种子，还有些有机肥料中含有不利于作物生长的有机化合物，所以，有机肥必须经过高质量发酵、加工处理后才能施用，生粪绝不能下地。在农业生产中也存在计量施用的问题。如果有机肥的用量太多，不仅是一种浪费，而且也可造成土壤障碍，影响作物生长发育。应根据土壤中各种养分及有机质的消耗情况合理使用，做到配方施肥、科学施肥。提高土壤的温度，同时，有机肥热容量较大，保温性能好，不易受外界冷热变化的影响，冬天防冻，夏天防暑，这对于果树根系萌芽、生长和越冬非常有利。参与堆肥过程的主要微生物种类是细菌、***以及放线菌。这3种微生物都有中温菌和高温菌。山西功能性有机肥品质保障
有机肥合理施用有机肥一般作基肥施用，也可作追肥。作基肥时先撒施，然后结合翻地深施均匀。还有就是壅根，蔬菜种植中将腐熟的有机肥壅在作物根部，可以起到促根壮秧的效果。有机肥在蔬菜种植中另一种施用方式是条施，即作物生长期作追肥，在作物行矩中间开一道沟，条施有机肥。同时顺沟灌水，然后土壤填沟。条施有机肥作追肥对作物生长期营养输送有特别好的效果。所以有机肥施用不管是撒施深翻土壤还是壅根、条施前提条件必须是腐熟。有机肥，主要来源于植物和（或）动物，施于土壤以提供植物营养为其主要功能的含碳物料。经生物物质、动植物废弃物、植物残体加工而来，消除了其中的有毒有害物质，富含大量有益物质，包括：多种有机酸、肽类以及包括氮、磷、钾在内的丰富的营养元素。不仅能为农作物提供营养，而且肥效长，可增加和更新土壤有机质，促进微生物繁殖，改善土壤的理化性质和生物活性，是绿色食品生产的主要养分。新疆原产地有机肥技术指导，甚至危及到生物的生存。 因此耕种帮建议合理使用有机肥料，既能减轻环境污染，又可以减少化肥投人。
枯草芽孢杆菌的作用机理：1、防治植物病害：①枯草芽孢杆菌与病原菌竞争营养和生态位点，消耗其周围养分，阻止和干扰病原菌对植物叶面和其它侵染，起到防病抑菌的作用。②产生抗生作用：枯草芽孢杆菌拈抗微生物通过产生多种代谢产物在低浓度下能够对病原菌的生长和代谢产生抑制作用，从而影响病原微生物的生存和活动。③寄生于病原菌体产生溶菌作用，其生长过程中产生的枯草菌素、多粘菌素、制霉菌素、短杆菌肽等活性物质，对致病性细菌具有较强的抑制作用；④诱导植物产生抗病性促进植物生长，增强植物体内抗病相关的酶的活性，增强植物抗病能力；2、促进有机物料矿质化和腐殖化：①加速物料矿质化，将养分由无效态和缓效态变为有效态；②加速物料腐殖化，分泌植酸酶，降解土壤中大部分的植酸盐；产生生长素，刺激作物生长，提高种子的成活率和出苗率。
这种集团颗粒内所含的营养成分不会因浇水、下雨就溶解出来，而是溶涨溶解，缓慢释放，直至全部松散开，这需要一定的时间。在集团颗粒全部松散开后，会出现一个松散集团区域，区域里的氮、磷、钾是较集中的，这时活化有机质内的1／4智能团在此高浓度氮、磷、钾集中区内暂不会把自己体内所含的氮、磷、钾释放，待松散区域里的氮、磷、钾逐渐减少时，这一部分氮磷钾才会慢慢释放出来。这样它又释放了一次肥力，使之肥效释放时间长、利用率高，可维持生长季一半以上的肥效，基本达到底肥的理想效果。农业部不久前已召开发布会，提出,要“增施有机肥”。
矿物源有机肥的原料的前体是动植物残体千百年矿化而成风化煤、褐煤，在改良土壤团粒结构、提高矿质营养元素利用率方面效用更佳。生物质有机肥的原料以畜禽粪便及秸秆腐熟为主，富含氨基酸、核酸、多肽、蛋白酶等活性成分，对树体的调理效用更明显。因此，土壤退化重的果园用矿物源有机肥更好，土壤情况良好的单施生物质有机肥就行。有机肥料中各种营养元素比较完全，而且这些物质完全是无毒、无害、无污染的自然物质，这就为生产高产、质量、无污染的绿色食品提供了必须条件。在大化肥承担了作物主要营养功能的当下，增施有机肥主要是利用其对作物的生理调节功能。中国台湾质量有机肥厂家批发价
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有机肥含有大量的有机质，具有明显的改土培肥的作用。有机肥含有多种养分，肥效持久，肥料中没有任何化学合成物质，长期施用可以改善农产品品质。有机肥经过充分腐熟处理，施用后可提高作物的抗旱、抗病、抗虫能力，减少农药的使用量。有机肥料中含有大量的有益微生物，可以促进土壤中的生物转化过程，有利于土壤肥力的不断提高。有机肥合理施用有机肥一般作基肥施用，也可作追肥。作基肥时先撒施，然后结合翻地深施均匀。还有就是壅根，蔬菜种植中将腐熟的有机肥壅在作物根部，可以起到促根壮秧的效果。山西功能性有机肥品质保障
