综合腺相关病毒AAV制备的三个工艺阶段介绍，可以看出下游处理可以占病毒生产总成本的很大一部分，而且难度也是非常大，尤其是纯化过程。原因之一是由于有超过100种不同血清型的变体AAV衣壳，不同血清型的AAV蛋白存在差异。因此，各种血清型的表面特性增加AAV纯化难度。原因之二是：针对工艺和产品相关的杂质（包括宿主细胞物质，DNA和空衣壳），缺乏一个有效和可重复的平台方法，尤其是来从空衣壳中分离出完整的衣壳。为了解决以上问题，国内外大的药企公司都致力于纯化新产品的开发，以期达到：（1）实现病毒颗粒的分离（2）减少产品相关杂质（3）保持效力和产量的目标。鉴于其在高盐条件下的较高活性，SAN HQ高盐核酸酶在不损失载体产量和活性的情况下改善了下游工艺。江苏进口生物试剂高盐核酸酶70960-001
Mayer等（2023）以measles virus(麻疹病毒，MV)为例，评估了四种不同核酸酶（BenzonaseTM、DeneraseTM、M-SAN HQ中盐核酸酶及SAN HQ高盐核酸酶）对于染色质DNA去除的效果。Vero细胞通过微载体贴壁培养来生产麻疹病毒MV，72hr后收获上清液，使用3µm cellulose filter(Sartorius)过滤后分装多份，置于-80℃保存便于后续使用。在解冻后的上清中调节对应盐浓度，并加入50 U/ml核酸酶，37℃孵育2hr进行消化，消化后留样；将消化后上清液过Capto Core 700 (Cytiva)柱子，收集流穿液，之后洗杂、洗脱，并分别留样。通过SDS-PAGE分析发现，相比Benzonase等传统核酸酶，在生理盐条件下M-SAN HQ中盐核酸酶更高效将染色质DNA剪切成更小片段，甚至将核小体DNA剪切更彻底。江苏SAN HQ高盐核酸酶70950-160高盐浓度能够减少目标产物聚集、增加目标产物溶解度及提高目标产物产量。
基因疗法制造商面临的挑战与抗体疗法刚出现时单克隆抗体制造商面临的挑战相似。例如，在生产、储存和处理过程中，单克隆抗体也会受到低滴度、产品和工艺相关杂质和降解的挑战。尽管与重组单克隆抗体相比，单剂量AAV产品与工艺相关杂质相关的风险可能更低（取决于杂质的类型、剂量和给药途径），但这也不能忽视。由于这些相似性，制药商、化学品和辅料供应商有机会进行合作，并开发创新的解决方案，以实现稳健和成本效益高的AAV产品生产。
ArcticZymes Technologies于2017年推出了SAN HQ高盐核酸酶及其对应的SAN HQ ELISA kit。该试剂盒原理是采用双抗夹心法定量检测各种生物制品的中间品、半成品和成品中SAN HQ高盐核酸酶的残留含量，特异性的anti-SAN作为捕获抗体偶联在96-well plate，生物素Biotin标记anti-SAN作为检测抗体，链霉亲和素-HRP偶联物起到信号放大作用，TMB是终反应底物。该试剂盒特异识别SAN HQ高盐核酸酶，对其它核酸酶没有特异性结合。它的定量范围是0.4-25.6ng/ml，检测精确度高RSD<=15%，2-8℃条件下保存12个月。SAN HQ高盐核酸酶能够使载体表面的DNA去除更彻底，得到的AAV病毒颗粒更稳定。
杆状病毒表达载体体系Baculovirus/Sf9(Baculovirusexpression vector，BEV)，是应用杆状病毒表达载体(BEV)系统infect昆虫细胞Sf9，是一种替代哺乳动物包装细胞系的生产方案。整个系统包含两种BEV，其中一个BEV携带两侧有ITRs的目的基因，另一BEV则携带rep/cap基因。这两种BEV同时infectSf9即可组装AAV。由于杆状病毒具有辅助功能，因此BEV系统与可以稳定表达rep的Sf9细胞相结合，可用于灵活的、高滴度的大规模载体生产。BEV体系安全性好,infection效率高,生产工艺较之sTT更易放大，有更高的体积生产率优势。在生物制品生产，如AAV载体及腺病毒载体疫苗生产中，宿主细胞DNA残留是关键质量参数之一。黑龙江进口生物试剂高盐核酸酶70950-150
在AAV生产过程中盐浓度是纯化工艺的重要参数之一。江苏进口生物试剂高盐核酸酶70960-001
跟其他类型的核酸酶一样，SAN HQ高盐核酸酶和M-SAN HQ中盐核酸酶的灭活方法有很多，分为可逆灭活及不可逆灭活。金属离子螯合剂如EDTA会可逆抑制两者的活性，加入的EDTA浓度一般是溶液中Mg2+浓度的2倍左右即可完全抑制活性；后续补加过量的Mg2+即可恢复核酸酶活性。加热、还原剂（如DTT）、咪唑、甘油及表面活性剂（如高于15%浓度的Triton X-100、SDS、尿素等）等都可以使其不可逆失活。在生物工艺流程，需要结合上下游应用需要选择合适的方法去除或灭活核酸酶。江苏进口生物试剂高盐核酸酶70960-001
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