为了让所有实验室都能同时快速自动消化多种抗体，Genovis的FabRICATORMagIC的设计具有灵活性，适用于一系列自动化平台。我们在ThermoScientific™KingFisher™纯化系统上优化了FabRICATORMagIC的工作流程，但它可以转移到其他自动化平台，如果没有自动化，在振动台上也能同样出色地工作。消解后，将含有处理样品的深孔板直接转移到LC-MS的自动进样器中进行快速色谱分析，或转移到其他分析方法进行分析。FabRICATORMagIC与在消解缓冲液中添加0.05%聚山梨醇酯20兼容，以极大限度地减少自动化系统中可能发生的纯粹压力。使用KingFisher仪器处理样品时，样品制备非常简单。将样品、树脂和缓冲液移液到指定的孔或板中，然后将板放入仪器中。设计用于FabRICATORMagIC的BindIt™协议将控制每个步骤的孵育温度和时间。用 Genovis的GlySERIAS Immobilized消化双特异性 T 细胞接合器（BiTE）分子。北京FabULOUSIdeS蛋白酶蛋白组学
用于IgA1和IgA2m1以上铰链消化的冻干酶。与IdeS不同，Genovis提供的IgASAPSub1+2在铰链上方的一个特定位点消化人IgA1和IgA2m1，产生完整且均匀的Fab和Fc片段。由于人IgA1的铰链比IgA2的铰链长，因此IgA1和IgA2m1之间来自消化位点的氨基酸C末端不同。IgASAPSub1+2可消化分泌物和血清IgA。孵育时间为过夜（16-18小时），并且由于酶的特异性，没有过度消化的风险。该酶在pH值为6.0至8.0时具有活性，不需要还原条件或辅助因子即可产生活性。活性为37°C。IgASAPSub1+2是从丹毒梭菌克隆而来的，并在大肠杆菌中表达。该酶含有His标签，分子量为131kDa。IgASAPSub1+2冻干剂以冻干粉的形式提供，装在1000个单位的小瓶中，用于消化1mgIgA1和IgA2m1。四川FabULOUSIdeS蛋白酶可用于研究特定Fc区域的质量属性，有助于研究GS连接子的修饰。
与IdeS不同，度拉糖肽由两个胰高xue糖素样肽-1 （GLP-1） 分子组成，它们通过柔性 GS 接头连接到人 IgG4 的 Fc 区域。为了分别研究肽和 Fc 区域，从而鉴定结构域特异性 PTM，用 Genovis的GlySERIAS 在 37°C 下冻干消化度拉糖肽 1 小时。为了降低样品复杂性，使用内切糖苷酶GlycINATOR Lyophilized去除Fc聚糖，并用DTT还原链间二硫键。反相LC-MS对样品的分析表明，使用GlySERIAS进行连接子消化后，肽从Fc区域完全去除。连接子中的大量甘氨酸残基为GlySERIAS提供了许多不同的潜在消化位点，这就是为什么Fc/2和GLP-1肽都被检测为几种变体，其中不同数量的甘氨酸和丝氨酸残基仍然连接。此外，还鉴定了GLP-1肽的氧化。尽管GlySERIAS同时在多个位点进行消化，但一式三份的酶解在获得的不同Fc/2变体的相对量中显示出可重复的结果。
Genovis提供具有低水平内Du素的FabRICATOR（IdeS）冻干酶，用于IgG的铰链以下消化。FabRICATOR（IdeS）是一种IgG特异性半胱氨酸蛋白酶，可消化铰链下方单个氨基酸位点的抗体，产生均质的F（ab'）2和Fc片段。FabRICATORLowEndotoxin以冻干粉的形式提供两种不同规格：2000和5000单位，分别用于消化2mg或5mgIgG。该产品配方每瓶的内Du素含量较低，2000单位小瓶的内Du素含量为<0.04EU/瓶，5000单位小瓶的内Du素含量为<0.10EU/瓶。有效消化，内DU素水平低；适用于灵敏的体内或基于细胞的检测。来自小鼠 IgG2a 和 IgG3 的片段可以由 FabRICATOR Z 生成。
与IdeS不同，Genovis的GingisREX（RgpB）是一种精氨酸特异性蛋白酶，可消化精氨酸残基的C末端蛋白质，包括难以与其他酶消化的Arg-Pro键。该酶可用于肽图分析、从头肽测序和翻译后修饰分析。精氨酸残基的特异性C-末端消化；在其他困难的精氨酸-脯氨酸序列中可靠消化；产生更长的肽-提高序列覆盖率。GingisREX是一种半胱氨酸蛋白酶，可特异性地消化肽键C末端到精氨酸残基，包括与脯氨酸相连的精氨酸。半胱氨酸是酶活性所必需的。与胰蛋白酶消化相比，可生成更长的肽，胰蛋白酶消化可以通过高分辨率质谱进行分离和鉴定。这为自下而上方法的样品制备提供了更多选择，以实现替代的酶解曲线和更高的序列覆盖率。GingisREX在赖氨酸上没有活性，通常使用Arg-C观察到。该酶在5.0-9.0的宽pH值范围内具有活性，它需要半胱氨酸并被盐酸胍抑制。该酶是从牙龈卟啉单胞菌中纯化的。使用胰岛素氧化β链来比较GingisREX和ArgC的酶特异性。上海FabDELLOIdeS蛋白酶蛋白组学
使用GlySERIAS 的连接子酶切可以通过分离连接的蛋白质结构域来帮助这种质量控制。北京FabULOUSIdeS蛋白酶蛋白组学
当你应用像肽图这样的方法时，你可以从Genovis中级方法中获得的信息量就没有那么多了。一个主要的区别是你不能像在肽水平上那样将修改定位到单个氨基酸。然而，中级分析比肽图谱具有快速和简单的巨大优势，因为需要分析的色谱峰要少得多，数据处理任务要简单得多。此外，在中级实验中，手工实验步骤要少得多，FabALACTICA（IdeS）酶切消化方法不需要针对不同的人体IgG1进行优化。一旦在氨基酸水平上进行了PTM表征，我们非常认为中级表征肽图的一种补充方法，可以在更常规的基础上应用。中级分析更适用于高通量或监测类型的方法，并可用于支持肽图分析。北京FabULOUSIdeS蛋白酶蛋白组学
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