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PNGaseF去糖基化酶基本参数
  • 品牌
  • Genovis
  • 型号
  • L1-F02-025
PNGaseF去糖基化酶企业商机

在这里,Genovis分析了 C1 抑制剂——一种人血浆衍生的生物zhiliao药物,由 6 种 N-聚糖和多达 28 种 O-聚糖修饰,主要由唾液酸he心 1 结构组成。在不对这种高度异质的蛋白质进行任何预处理的情况下,反相LC-MS分析产生了无法详细解释的复杂质谱图。在天然条件下使用OmniGLYZOR Microspin色谱柱,可在3小时内有效去除所有O-聚糖。然而,蛋白质上仍残留着 1 到 3 个 N-聚糖。使用冻干的PNGase F和OmniGLYZOR试剂盒中包含的MS友好型RapiGest™ SF表面活性剂*,在变性条件下通过额外的去糖基化步骤去除这些不可接近的N-聚糖。观察到所有聚糖的完全去除,但分子上存在的少量he心 2 O-聚糖除外。水解O-聚糖的酶不会从变性中获益,这就是为什么OmniGLYZOR Microspin色谱柱只能在非变性条件下使用的原因。FucosEXO 可在 1 至 2 小时内水解糖蛋白上的末端 α1-2,3,4 。云南高活性/无非特异酶活PNGaseF去糖基化酶糖生物学研究

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Genovis的ImpaRATOR™ 可用于多种 O-聚糖:依那西普是一种融合蛋白,由TNF受体的胞外结构域与人IgG1的Fc部分相连。该蛋白质在Fc区域上方含有多达13个O-糖基化的Ser/Thr残基簇,使其成为一种非常难以在结构上表征的生物制药。为了证明ImpaRATOR的聚糖特异性,制备了三种具有不同聚糖组成的依那西普样品:(i)携带单唾液酸和二唾液酸化he心1结构混合物的未经处理的糖蛋白,(ii)用SialEXO处理的糖蛋白去除唾液酸并产生裸核1结构,以及(iii)用SialEXO和GalactEXO处理的糖蛋白产生单个GalNAc残基, 也称为Tn抗原。用ImpaRATOR和FabRICATOR在一锅反应中处理三个样品(图1)。作为比较,SialEXO处理的依那西普用OpeRATOR和FabRICATOR处理。将所得肽还原、烷基化并用HILIC-MS进行分析。FabRICATOR被包括在反应中,以将Fc区与大多数C端糖肽分离,以促进其表征。甘肃瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶SialEXO用于OpeRATOR或OglyZOR消化前预处理O-糖基化蛋白。

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Genovis的GlycOCATCH®是一种亲和树脂,可特异性结合O-糖基化(粘蛋白型)蛋白和肽,从而实现简单的工作流程,以富集和纯化携带O-聚糖的蛋白质和肽。洗涤离心柱,并用8M尿素洗脱结合的蛋白质。对洗脱材料的分析表明,由于洗脱O-糖基化蛋白,并且树脂与非糖基化蛋白和N-糖基化蛋白的结合可以忽略不计。选择性结合 O-糖蛋白:为了测试选择性,将一系列 O-糖基化、N-糖基化和非糖基化蛋白与Genovis的GlycOCATCH 一起孵育。为了在肽水平上研究Genvois的GlycOCATCH的O-糖特异性,将O-glcyosyled肽(糖蛋白)与一系列未修饰的肽混合。

Genvois的SialEXO产品是唾液酸酶,用于N-和O-糖基化蛋白的有效去唾液酸化。SialEXO冻干由两种唾液酸酶组成,每种唾液酸酶都具有独特的活性,并且它们同时起作用。一种酶对α2-3、α2-6和α2-8连接的唾液酸具有很好的活性,另一种酶(SialEXO 2-3)通过α2-3-键快速水解唾液酸。SialEXO冻干可在2小时内去除天然蛋白质上的所有唾液酸。SialEXO在天然条件下水解糖蛋白,在pH值范围为6.5至9时显示出活性。这些酶来源于Akkermansia muciniphila,并在大肠杆菌中表达。两种酶都含有 His 标签,酶的分子量为 43 kDa 和 66 kDa。 用于LC-MS分析之前制备样品,以鉴定其他PTM或确认氨基酸序列。

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该酶适用于在释放的聚糖结构上修剪半乳糖,用于外切糖苷酶阵列,或用于生成具有均相 G0/G0F 聚糖谱的抗体。1. 高效β-半乳糖苷酶混合物 – 快速去除末端 β1-3 和 β1-4-连接的半乳糖;2. 有助于在亚基水平上识别糖基化修饰;3. 可固定在即用型离心柱中。Genovis的GalactEXO是一种外切糖苷酶,含有β-半乳糖苷酶的混合物,可有效去除N-和O-糖基化蛋白或寡糖上的半乳糖残基。该混合物由两种半乳糖苷酶组成,可高效水解 β1-3 和 β1-4 连接的半乳糖酶。GalactEXO在天然条件下水解糖蛋白,并在5.5至7.5的宽pH值范围内显示活性。两种酶都含有 His 标签,酶的分子量为 43 kDa 和 66 kDa。甘肃瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶

PNGase F 固定化微离心柱含有与琼脂糖珠共价偶联的 PNGase F 酶,用于在z终样品中酶峰减少的糖蛋白上水解 N-糖。云南高活性/无非特异酶活PNGaseF去糖基化酶糖生物学研究

Genvis测试去除唾液酸以揭示电荷变体:唾液酸是带负电荷的糖残基,存在于 N- 和 O-连接的聚糖上。唾液酸的固有电荷可能会使分析工作流程复杂化,从而掩盖其他重要的修饰。Microspin 色谱柱可用于 2 x 0.5 mg、5 x 0.5 mg 或 10 x 0.5 mg 糖蛋白的去唾液酸化。1. 易于使用的离心柱;2. 提高酶与底物的比例,提高消化效率;3. 样品中不含酶。因此,唾液酸的去除有助于研究蛋白质中的潜在变体。该应用展示了一种快速简便的样品制备方法,可在电荷异构体分析之前去除所有唾液酸。云南高活性/无非特异酶活PNGaseF去糖基化酶糖生物学研究

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