离子交换层析 (IEC) 是一种简单、通用且经济高效的技术，已成为许多载体纯化的关键步骤。IEC分为阴离子/阳离子交换柱，其中AEC（Anion-exchange chromatography）适用于AAV纯化，是大规模AAV生产中去除空衣壳的主要手段。AAV衣壳亚种之间因表面电荷的差异导致不同的的等电点。空衣壳PI在6.3左右，包装了完整基因组DNA后的病毒颗粒PI大致为5.9。AAV与基质之间的静电相互作用正是取决于衣壳的等电点(pI)和缓冲液的pH值。基于这一原理在正电荷固定相上进行样品的分离纯化，去除杂质（如空衣壳和部分衣壳），并有效地回收目的载体。ArcticZymes厂家管控整个供应链及生产流程，协助客户进行文件审计及现场审计。江苏高盐核酸酶70921-150
AAV病毒滴度通常分为物理滴度和infection滴度。物理滴度一般是指基因组滴度或者衣壳滴度。在测定AAV的含量时，通常采用基因组滴度或者衣壳滴度作为单位，其中基因组滴度为携带基因组的AAV的浓度，衣壳滴度为AAV物理颗粒的浓度。基因组滴度一般采用qPCR、ddPCR、染料法、UV/Vis等方法来测定；衣壳滴度主要是通过ELISA、HPLC等方法来测定。AAV基因组滴度检测的关键在于尽可能彻底去除AAV衣壳外的HCD残留，减少污染核酸对qPCR或ddPCR的影响。经典方法是加入常规核酸酶（如Dnase I、Benzonase等）消化AAV衣壳外的HCD残留，然后加入Proteinase K破碎病毒衣壳，进行后续检测。经过对比发现，用SAN HQ高盐核酸酶替代常规核酸酶处理AAV病毒，能够更高效去除衣壳外的核酸残留，qPCR或ddPCR结果重复性更高、更稳定。江苏高盐核酸酶70921-150US FDA指南要求：重组生物制品终产品中，核酸杂质含量低于10ng/dose。
已有文献表明，高盐浓度能够破坏染色质结构，让核小体解聚。在能耐受高盐条件的病毒载体（如AdV/AAV等）生产中，高盐浓度使宿主细胞DNA（HCD）解聚，让核酸片段暴露，提高了核酸片段的可及性。而ArcticZymes的SAN HQ高盐核酸酶能够在高盐条件下更好发挥酶切活性，作为高盐条件下去除HCD的更好选择。SAN HQ高盐核酸酶的出现，让一些通过常规方法很难解决的工艺问题得到高效解决，不仅提高了生产效率，降低了药物生产成本，更拓宽了生物工艺生产的边界。
由于Triton X-100的降解产物对环境影响很大，自2023年12月22日起，欧盟将禁止使用Triton X-100生产试验性医疗产品等。请注意，含有≤0.1% (w/w) Triton X-100表面活性剂的物质不被视为危险物质，仍然可以进口到欧洲。由于该产品通常不用作生物制品或先进疗法的赋形剂，因此在欧洲以外生产的大多数药物在其开发商考虑在欧盟生产之前不需要生产变更。此外，已经获得许可的药物及其赋形剂不受该规则约束。所有其它希望在欧盟生产生物药物和研究产品的生产商都必须寻求Triton X-100的替代品并验证它们对各自用途的适用性。为了支持客户项目更好在欧盟区域申报上市，ArcticZymes Technologies于2019年推出了Triton X-100 Free的SAN HQ TF高盐核酸酶。与SAN HQ高盐核酸酶相比，SAN HQ TF用Tween-20替代了Triton X-100，酶活性能完全一致。目前，SAN HQ和SAN HQ TF都有项目在临床阶段，相关性能都得到了行业客户的认可。宿主细胞DNA主要以染色质形态存在，其中的组蛋白通过离子相互作用及疏水相互作用与DNA紧密结合；
监管部门对HCD的残留量有明确的规定。美国FDA发布的指导原则中指出生物制品HCD残余限度为 100pg/剂，对于大剂量生物制品如单克隆抗体，根据其残留DNA来源及给药途径，残留量可放宽至 10ng/剂。细胞基因药物终产品的DNA残留有两种来源，分别是宿主细胞DNA（HCD）和转染用的质粒。质粒和HCD的存在形式不同，去除效率也差别很大。其中，质粒是裸露的DNA双链，带强负电荷，通过色谱纯化主要是离子交换能够很高效去除；HCD则是以核小体紧密折叠形成的染色质形式存在，几乎不以裸DNA形式存在，所以很难去除。使用Benzonase时，不能把载体表面的DNA去除彻底，因而不能阻止纯化的病毒载体聚集。湖南ArcticZymes高盐核酸酶70921-150
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在生物工艺流程中，需要使用核酸酶去除终产品中的核酸污染，而核酸酶作为外源成份，也需要在生产流程中去除。核酸酶去除工艺包括热灭活法、酶抑制剂、离子交换和亲合层析法等。AAV衣壳亚种之间因表面电荷的差异导致不同的的等电点，——空衣壳pI在6.3左右，包装了完整基因组DNA后的病毒颗粒pI大致为5.9。而来自于S.marcescens的全能核酸酶pI 6.85左右，SAN HQ高盐核酸酶pI 9.6左右。因此，在同样的条件下，从AAV溶液中去除SAN HQ高盐核酸酶比去除Benzonase全能核酸酶更容易、更彻底。江苏高盐核酸酶70921-150
