上海二代测序检测

①二代测序一般多久出结果？

二代测序（Next-GenerationSequencing，NGS）出结果的时间会受到多种因素的影响，一般在数天到数周不等。

1、样本类型和质量

不同的样本类型处理时间不同。例如，血液样本相对容易处理，提取DNA的过程比较常规。如果是组织样本，可能需要先进行样本的解离等复杂操作。如果样本质量高，DNA提取和文库构建等前期工作会比较顺利，能加快整体进程。但如果样本量少或者DNA有降解等质量问题，可能需要重新提取样本或者进行DNA修复等操作，这会**延长时间。例如，对于新鲜血液样本，DNA提取可能在1-2天内完成；而对于一些福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）组织样本，可能需要3-5天来完成高质量DNA的提取和后续的优化处理。

二代测序广泛应用于医学研发。上海二代测序检测

一代、二代、三代测序的技术原理和技术特点分别是什么？

技术原理：

一代—双脱氧终止法

二代—桥式PCR+4色荧光可逆终止+激光扫描成像

三代—PacBio SMRT测序技术

技术特点：

一代—只能检测序列一致的PCR产物；读长可以较长，比如Sanger可以达到几百bp；通量低，一次只能检测少量的序列；成本低；

二代—可以并行测序；需要放大信号才能检测；通量大，可以产生上G的reads；读长较短，一-般是固定的，比如50、100、150、250等；成本较高

三代：可以并行测序；不需要放大信号，对单个分子进行测序；通量大，比如SequelII平台，一张芯片可以有800万个ZMW；读长较长；测序精确度较差；成本高； 青海二代测序提供二代测序可以边合成边测序吗？

二代测序的操作流程有哪些？

1.DNA提取与质检

· 纯净、足量、质量好的样本DNA是检测成功的基础（可以来源于血浆、新鲜组织等）

2.DNA处理→文库构建

· 得到统一长度区间+有接头的DNA片段

· 步骤：DNA打断→末端修复→片段筛选→加A尾→接头连接→PCR

3.靶向捕获

· 特定区域基因的定向检测

4.上机测序

· 根据通量情况选择测序仪

· 上样后机器完成

5.数据分析

· 初级分析：光强数据（不同荧光标记碱基）→序列信息（AGCT）

· 二级分析 多仪器自带

· 三级分析 vcf文件 可diy

宏基因组二代测序，你了解多少？

宏基因组二代测序（mNGS）是一项覆盖病原谱广且高通量的检测技术，已在临床领域得到了广泛的应用。对于血液病患者，病原mNGS通过对样本快速高通量测序，可以获得更准确、相对无偏倚的病原信息，对病原诊断起到积极的作用，尤其对传统微生物学检测未覆盖到或检测周期较长、阳性率较低的病原可提高检出率。对于临床相关样本应首先完善传统微生物学检测，病理、无菌标本培养仍然是诊断的金标准，病原mNGS是对传统微生物学检测的有力补充和延展而非替代。病原mNGS的报告解读应充分评估检出微生物的致病性、流行病学、生物信息学信息，同时在结合患者临床特征的基础上进行综合判断。 二代测序是先打断DNA，使其片段化。

②二代测序一般多久出结果？

2、测序平台和通量

不同的二代测序平台有不同的通量（一次能测序的样本数量和数据量）和测序速度。一些高通量的测序平台，如IlluminaNovaSeq系列，能够在较短时间内产生大量的数据。但如果使用的是通量较低的小型测序仪，或者测序仪的运行时间被多个项目分配，都会影响结果产出的时间。例如，在高通量平台上进行全基因组测序，测序运行时间可能在2-7天左右，具体取决于测序深度等因素。而对于一些小型台式测序仪进行靶向基因测序，运行时间可能在1-3天。 二代测序是2005年以后开始的吗？湖南二代测序流程

二代测序是一种能够同时对数百万甚至数十个亿DNA片段进行测序的方法。上海二代测序检测

二代测序——甲基化的作用和检测方法有哪些？

作用

基因表达调控：DNA 甲基化通常与基因沉默有关。例如，在**发生过程中，某些抑*基因的启动子区域（调控基因转录起始的 DNA 序列）可能会发生高甲基化，导致这些基因无法正常表达，从而失去对肿瘤细胞生长的抑制作用。

发育调控：在胚胎发育过程中，DNA 甲基化模式的动态变化对于细胞分化和组织***形成至关重要。不同的细胞类型具有特定的 DNA 甲基化图谱，这些图谱引导细胞向特定的方向分化。

检测方法

亚硫酸盐测序法：这是一种能够精确检测 DNA 甲基化状态的方法。其原理是利用亚硫酸盐处理 DNA，未甲基化的胞嘧啶会被转化为尿嘧啶，而甲基化的胞嘧啶则保持不变。经过 PCR 扩增和测序后，可以区分甲基化和未甲基化的位点。 上海二代测序检测