吉林哪里有二代测序应用

WES测序

局限性

检测范围有限：无法检测外显子间区域和非编码序列区域的变异，也不能覆盖整个基因.

对某些变异不敏感：在检测重复序列扩增、G-富集区域和GC含量高的区域等变异时，效果可能不佳.

应用

遗传病诊断与研究：可诊断病因不明的遗传病，明确致病突变，还能用于产前诊断，辅助家庭生育决策.

**研究：助力**基因突变检测，为**的早期诊断、***方案制定及预后评估提供依据.

药物基因组学：检测结果可指导医生选择靶向药物或进行基因***，实现精细医疗. 二代测序是为了改进一代测序通量过低的问题而出现的。吉林哪里有二代测序应用

二代测序的操作流程有哪些？1.DNA提取与质检·纯净、足量、质量好的样本DNA是检测成功的基础（可以来源于血浆、新鲜组织等）2.DNA处理→文库构建·得到统一长度区间+有接头的DNA片段·步骤：DNA打断→末端修复→片段筛选→加A尾→接头连接→PCR3.靶向捕获·特定区域基因的定向检测4.上机测序·根据通量情况选择测序仪·上样后机器完成5.数据分析·初级分析：光强数据（不同荧光标记碱基）→序列信息（AGCT）·二级分析多仪器自带·三级分析vcf文件可diy浙江哪里有二代测序检测二代测序广泛应用于个性化医学。

二代测序应用于蛋白组测序的常见方式①？

基于转录组测序间接推断蛋白信息

原理：由于蛋白质是由mRNA翻译而来，先利用二代测序技术对转录组（主要是mRNA）进行高通量测序，获得基因转录水平的信息。基于中心法则中mRNA和蛋白质的对应关系，在一定程度上可以推测出相应蛋白质可能的表达情况。例如，通过分析mRNA的表达量高低，预估对应蛋白质的丰度趋势。如果某个基因的mRNA在样本中表达量很高，那么大概率其翻译产生的蛋白质在细胞内的含量也相对较高，但这只是初步推断，因为还存在翻译后调控等影响因素。

应用案例：在研究某种植物在不同生长阶段的蛋白表达变化时，先进行转录组测序，发现与光合作用相关的一些关键基因的mRNA在植物生长旺盛期表达量***上调，后续再通过其他蛋白检测手段验证到对应的光合作用相关蛋白质含量确实增多，这就体现了通过转录组测序间接了解蛋白表达趋势的可行性。

二代测序——RNA甲基化的概念、作用和检测方法RNA甲基化概念及位置：RNA甲基化是在RNA分子上添加甲基基团，其中N6-甲基腺苷（m6A）是最常见的一种RNA甲基化修饰形式，它主要发生在mRNA（信使RNA）的腺嘌呤（A）残基上。作用1、影响RNA的稳定性：m6A修饰可以影响mRNA的稳定性。例如，一些带有m6A修饰的mRNA更容易被降解，从而调控基因表达的时间和水平。2、调节RNA的剪接和翻译：m6A修饰还能够调节mRNA的剪接过程，影响不同转录本的生成。同时，它也可以在翻译水平上发挥作用，影响蛋白质合成的效率。检测方法甲基化RNA免疫沉淀测序（MeRIP-Seq）：这种方法主要是利用特异性识别m6A修饰的抗体，对RNA进行免疫沉淀富集，然后通过高通量测序来鉴定m6A修饰的位点和水平。二代测序产出的数据量有多少？

常见的二代测序平台有哪些？

二、IonTorrent系列

包括Proton/PGM等型号，其技术基于半导体芯片，可检测DNA聚合反应中释放的氢离子，从而实现对DNA序列的测定，通量适中，测序速度快，适用于快速检测和一些临床诊断应用，如病原体检测等.

华大智造系列DNBSEQ-T7/T20：通量高，能够快速完成大量样本的测序工作，适用于大规模的基因组学研究和临床检测项目，如群体基因组测序、**基因突变检测等.MGISEQ-2000：性能稳定，可提供准确可靠的测序数据，在转录组测序、全基因组甲基化测序等多种应用场景中都有良好表现.

赛纳生物S100利用流式荧光发生测序化学技术和ecc纠错编码测序技术，将测序精度提升至Q40，可检出0.1%低频突变，在bitseq简并测序模式下，**快6.5小时完成基因测序，适用于未知病原微生物等亟需快速检测的场景. 二代测序读长方面比一代测序短很多。云南哪里有二代测序价格

二代测序的优势是高准确性。吉林哪里有二代测序应用

二代测序的建库步骤、末端修复和加A尾（以DNA文库为例）末端修复：经过片段化后的DNA末端可能是不平齐的，有5'-突出端或3'-突出端。末端修复反应可以利用T4DNA聚合酶、Klenow片段等酶，将这些末端补平，使其成为平末端。T4DNA聚合酶具有5'→3'聚合酶活性和3'→5'外切酶活性，在合适的反应缓冲液和dNTP（脱氧核糖核苷三磷酸）存在下，可以将突出的末端补平。加A尾：在末端修复后的平末端DNA分子的3'-末端加上一个A碱基。这一步是为了后续连接带有T-突出端的接头做准备，一般使用Klenow片段（3'→5'外切酶活性缺失）在dATP存在下进行加A反应，这样可以使DNA片段能够高效地与带有T-突出端的测序接头连接。吉林哪里有二代测序应用