PCR引物设计的原则PCR反应中有两条引物,即5′端引物和3′引物。设计引物时以一条DNA单链为基准(常以信息链为基准),5′端引物与位于待扩增片段5′端上的一小段DNA序列相同;3′端引物与位于待扩增片段3′端的一小段DNA序列互补。(1)引物设计的基本原则引物长度:15-30bp,常用为20bp左右。引物碱基:G+C含量以40-60%为宜,G+C太少扩增效果不佳,G+C过多易出现非特异条带。ATGC比较好随机分布,避免5个以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列参照。引物内部不应出现互补序列。两个引物之间不应存在互补序列,尤其是避免3′端的互补重叠。引物与非特异扩增区的序列的同源性不要超过70%,引物3′末端连续8个碱基在待扩增区以外不能有完全互补序列,否则易导致非特异性扩增。引物3‘端的碱基,特别是较末及倒数第二个碱基,应严格要求配对,比较好选择是G和C。引物的5′端可以修饰。如附加限制酶位点,引入突变位点,用生物素、荧光物质、地高辛标记,加入其它短序列,包括起始密码子、终止密码子等。荧光定量pcr的ct值怎么分析?样本pcr价格

长片段PCR通常指扩增大于5kb的DNA的片段。长片段PCR传统上使用TaqDNA聚合酶(为了快速延伸)和高保真酶(为了准确度)的混合物。随着高合成能力、高保真DNA聚合酶的发明,长片段PCR现在可在短时间内高准确性的完成。通过与一个强DNA结合蛋白的结合,聚合酶可获得高扩增能力,可在短时间内扩增长片段(如>20kbgDNA的片段)。初次之外,极高保真度(如>100xTaq)可确保长片段扩增的低错误率。当扩增>10kb的片段时,PCR实验方案可能需要在以下5个关键位置进行适当优化:确保使用高质量、高纯度的DNA样本。如果DNA聚合酶的热稳定较低,使用更多量的DNA聚合酶以弥补多次循环中的聚合酶活性损失。降低退火和延伸步骤的温度,以助于引物结合。适当增加PCR步骤的时间,以促进模板DNA的完全分离及引物的结合。适当增加PCR延伸时间确保目的片段的全长扩增。山东组织pcr扩增荧光定量pcr和实时定量pcr的区别?

PCR实验技术中的Touch-downPCR介绍:Touch-downPCR又称降落PCR.即选定一个温度范围,如50—35℃,每降1-2℃进行1-2个循环,然后在50度下进行15个循环。Touch-down的原理随着退火温度的降低,特异性逐步降低,但特异性条带在温度较高时已经扩增出来,其浓度远远超过非特异性条带,随着退火温度的降低,特异性条带优先被扩增。选择初始复性温度的原则起始复性温度应该比引物的Tm值高出5-10度,然后每个循环递减1-2度Touch-downPCR的应用范围lowcopyoftargetedDNA;highdegreedegeneracy(orlessspecific)ofthefirstsetofprimers;
PCR出现非特异性扩增带的原因分析:PCR扩增后出现的条带与预计的大小不一致,或大或小,或者同时出现特异性扩增带与非特异性扩增带。非特异性条带的出现,其原因:一是引物与靶序列不完全互补、或引物聚合形成二聚体。二是Mg2+离子浓度过高、退火温度过低,及PCR循环次数过多有关。其次,是酶的质和量,往往一些来源的酶易出现非特异条带而另一来源的酶则不出现,酶的量过多有时也会出现非特异性扩增。其对策有:①必要时,重新设计引物。②减低酶的量或调换另一来源的酶。③降低引物量,适当增加模板量,减少循环次数。④适当提高退火温度或采用二温度点法(93℃变性,65℃左右退火与延伸,也叫两步法)。pcr检测实验数据如何分析?

PCR的临床应用主要用于针对疾病遗传病等。PCR在医学检验学中**有价值的应用领域就是对疾病的诊断。理论上,只要样本有一个病原体存在,PCR就可以检测到。一般实验室也能检出10~100基因拷贝,而目前病原体抗原检测方法一般需要105-7个病原体才可检测到。PCR对病原体的检测解决了免疫学检测的“窗口期”问题,可判断疾病是否处于隐性或亚临床状态。定量PCR研究资料已表明,病原体数量与疾病病情的轻重程度、传染性及针对效果均有相关性。许多研究表明,人类免疫缺陷病毒(HIV)后,潜伏期长短和临床症状轻重与血液中的病毒量相关;也有研究表明,HIV病毒载量低于一定值时,没有传染性。在乙型肝炎病毒、丙型肝炎病毒定量研究中发现,病毒的数量与某些药物的疗效相关。例如,干扰素针对对肝炎病毒高拷贝者不敏感,低拷贝者敏感;而有些药物则具有***降低病毒高拷贝的作用。pcr检测的价格是多少?浙江样本pcr
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PCR的特异性影响因素有很多,在此我们作一归纳,供大家参考:①退火步骤的严格性:提高退火温度可以减少不匹配的杂交,从而提高特异性。②减短退火时间及延伸时间可以减少错误引发及错误延伸。③引物二聚体是较常见的副产品,降低引物及酶的浓度也可以减少错误引发,尤其是引物的二聚化。④改变mgcl2(有时kcl)浓度可以改进特异性,这可能是提高反应严格性或者对taq酶的直接作用。一般认为PCR产物应在48h以内完成电泳检测,有些比较好于当日电泳检测,大于48h后带型就会出现不规则,甚至消失。样本pcr价格
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