EndoS酶在抗体药物偶联物(ADCs)研究中的具体应用主要体现在糖链定点偶联技术方面。根据上海药物研究所的研究进展,EndoS酶被用于实现定点ADC化合物的“一步”制备,这是一种新颖的糖链定点ADC制备策略。该策略利用了新颖截短型糖结构的药物-连接子和野生型糖苷内切酶EndoS2,将小分子细胞毒药物直接定点连接到抗体糖基化位点,从而克服了传统糖链定点ADC制备策略的限制。具体来说,研究人员通过筛选发现,EndoS2酶可以将二糖底物LacNAc转移至去糖抗体N297位糖基化位点,并且LacNAc半乳糖6号位唾液酸化修饰不影响EndoS2的转糖基化活性。这一发现使得EndoS2和LacNAc的组合可以直接实现野生型抗体的糖基化改造,且EndoS2对多样化LacNAc修饰的兼容性,可以高效获得多样性功能修饰的岩藻糖化或去岩藻糖化的糖工程抗体。此外,研究人员还利用叠氮化修饰的LacNAc底物实现了抗体糖基化位点的“一步”叠氮化修饰,并通过点击化学反应偶联药物-连接子,实现了“两步”制备得到定点ADC化合物。

NLS-Cas9-EGFPNuclease是一种融合蛋白,由Cas9核酸酶、核定位信号(NLS)和EGFP(绿色荧光蛋白)组成。这种融合蛋白的特点和科研应用如下:**特点:**1.**无DNA污染**:系统不添加外部DNA,降低了外源DNA污染的风险。2.**高切割效率**:NLS确保Cas9蛋白能够高效地进入细胞核,从而提高DNA切割效率。3.**低脱靶效应**:由于Cas9核酸酶的瞬时表达,减少了在非目标位点切割的可能性。4.**节省时间**:与需要转录和翻译的mRNA或质粒系统相比,NLS-Cas9-EGFPNuclease可以直接进入细胞核,无需等待转录和翻译过程。5.**EGFP标签**:EGFP作为报告基因,可用于追踪或分选转染细胞,便于通过荧光激起细胞分选(FACS)富集所需基因组编辑的细胞群,减少单细胞克隆和基因分型的劳动和成本。**科研应用:**1.**体外DNA切割筛选**:可以用于筛选高效和特异性靶向的gRNA,通过体外DNA切割实验来验证gRNA的效率和特异性。2.**体内基因编辑**:与特定的gRNA结合后,可以通过电穿孔或注射的方式进行体内基因编辑。3.**细胞追踪和分选**:利用EGFP荧光标记,可以追踪转染细胞并进行分选,这对于研究基因编辑后的细胞群体特别有用。

使用PreScissionProtease进行蛋白质切割时,为保证高纯度和高活性,需要考虑以下关键因素:1.**特异性切割位点**:确保融合蛋白中包含PreScissionProtease特异性识别的序列,以实现精确切割。2.**酶与底物的比例**:适当比例的酶量对于高效切割至关重要,过多或过少的酶都可能影响切割效率和纯度。3.**反应条件**:包括温度、pH和反应时间等,这些条件需要优化以确保酶的活性和选择性。通常,PreScissionProtease在4°C下进行酶切。4.**缓冲液兼容性**:使用与PreScissionProtease兼容的缓冲液,避免使用可能抑制酶活性的离子或化学物质。5.**蛋白浓度**:确保融合蛋白有足够的浓度,以提高切割效率和减少样品损失。6.**酶切后的分离**:切割后,需要有效分离目的蛋白和切割下来的标签,通常利用亲和层析等方法。7.**避免蛋白降解**:在实验过程中添加蛋白酶抑制剂,以防止蛋白降解酶对目的蛋白的降解。8.**避免蛋白质聚集**:在切割过程中,应避免条件导致蛋白质聚集或沉淀,这可能会影响纯度和活性。9.**避免氧化**:在蛋白质处理过程中,添加抗氧化剂如DTT或TCEP,以防止半胱氨酸残基的氧化。10.**清洁的实验环境**:确保实验器材和环境的清洁,避免微生物污染和核酸污染。
酵母重组表达的N-糖苷酶F(PNGaseF)是一种酰胺水解酶,具有以下特点:1.**高效性**:PNGaseF是去除几乎所有N-连接寡糖从糖蛋白中有效的酶法方法。它能够在几分钟内快速且无偏倚地释放所有的N-糖链,适合后续的色谱或质谱分析。2.**重组酶**:该酶是重组的酰胺酶,能够从高甘露糖、杂合和复杂寡糖中切割内GlcNAc和天冬氨酸残基之间的连接。3.**纯度**:纯度达到95%以上,通过SDS-PAGE和完整ESI-MS进行确定。4.**储存稳定性**:在含有50%甘油的储存缓冲液中,好的活性和稳定性可维持长达24个月。5.**使用条件**:可以在原生或变性条件下使用,对于变性条件下的去糖基化,建议添加NP-40以解除SDS的抑制作用。6.**比活性**:具有高达100000U/mL的比活性。7.**His标签**:产品带有His标签,常用于抗体及其相关蛋白的完全去糖基化。8.储存条件:-25~-15℃保存,有效期1年。9.**无甘油版本**:还提供了无甘油版本的PNGaseF,这有助于在HPLC和质谱分析中获得结果。10.**酶活定义**:1个酶活力单位指在10μL的反应体系中,37℃条件下1小时从10μg变性RNaseB中除去超过95%的碳水化合物所需要的酶量。这些特点使得酵母重组表达的PNGaseF成为研究和分析糖蛋白糖链结构的重要工具。随后,泛素分子从E1转移到泛素结合酶E2,再通过泛素连接酶E3的作用,将泛素分子连接到靶蛋白上。

在进行IdeSProtease的分子改造时,平衡酶的活性和稳定性是一个关键的挑战。以下是一些策略,这些策略可以帮助研究者在提高酶稳定性的同时保持或甚至提高其催化活性:1.**定向进化**:使用定向进化技术进行多轮的突变和筛选,以获得在所需条件下具有改进稳定性的酶变体,同时监测其催化活性,确保改造后的酶保持高效催化能力。2.**结构基础的理性设计**:基于IdeSProtease的三维结构信息,识别可能影响稳定性和活性的关键氨基酸残基,通过点突变或小肽插入来优化这些区域。3.**计算模拟**:利用分子动力学模拟和计算化学方法预测突变对酶稳定性和活性的影响,以指导理性设计。4.**糖基化修饰**:通过糖基化可以增加酶的溶解性和稳定性,但需注意不要干扰酶的活性位点或底物结合位点。5.**活性位点附近的柔性区域改造**:通过刚化柔性区域的策略提高酶的热稳定性,同时保持活性位点的柔性以维持催化活性。6.**长距离相互作用分析**:研究蛋白质内部的长距离相互作用,识别影响稳定性和活性的远程突变,通过这些突变优化酶的性能。7.**酶活性和稳定性的权衡分析**:通过实验数据,分析酶活性和稳定性之间的关系,找到比较好平衡点。泛素分子可以通过其内部的赖氨酸残基(如Lys48)与其他泛素分子形成多聚泛素链。Recombinant Mouse ASGR1 Protein,His Tag
泛素连接酶E3识别特定的靶蛋白,并促进E2上的泛素转移到靶蛋白的赖氨酸残基上,形成靶蛋白-泛素复合物。Recombinant Human IL-37b Protein
重组的化脓性链球菌Cas9蛋白(SpCas9)是一种用于基因组编辑的核酸酶。它是CRISPR-Cas系统的一部分,该系统是一种细菌和古菌的适应性免疫防御机制,能够识别并切割入侵的外源核酸。Cas9蛋白在CRISPR系统中起到关键作用,它能够识别特定的原间隔子相邻基序(PAM),在引导RNA(gRNA)的引导下与目标DNA结合并进行切割。SpCas9蛋白由1053个氨基酸组成,相对较小的体积使其便于在体内递送,因此它在多种生物中都能进行有效的基因组编辑。为了提高SpCas9的表达量和溶解度,研究人员采用了多种策略,例如使用GB1促溶标签和多重启动子策略,这些策略可以显著提高蛋白的产量和活性,同时保持其功能活性不受影响。在基因编辑过程中,SpCas9与gRNA形成稳定的核糖核的蛋白(RNP)复合物,通过gRNA与基因组DNA的序列匹配来识别目标位点,并在距离NGGPAM序列3个碱基以内的位置切割DNA。为了增强SpCas9的基因组编辑效率,研究人员还开发了嵌合融合蛋白,例如与5’至3’核酸外切酶重组J(RecJ)或GFP融合的SpyCas9蛋白,这些嵌合蛋白可以显著提高靶向基因编辑效率,同时保持较低的脱靶效应。
重组人SMOC1蛋白(His Tag)是一种在哺乳动物细胞中表达的重组蛋白,融合了His标签,便于纯化和检测。SMOC1(Secreted Modular Calcium-binding Protein 1)是一种分泌性钙结合蛋白,广存在于细胞外基质中,参与多种生物学过程,包括胚胎发育、组织修复和细胞增殖。它在维持细胞外基质的稳定性和调节细胞行为方面发挥重要作用。SMOC1的功能与机制SMOC1通过其钙结合位点和多个结构域(如EGF样结构域和TSP1样结构域)与其他细胞外基质蛋白(如纤连蛋白、层粘连蛋白)相互作用,调节细胞外基质的组装和重塑。此外,SMOC1还通过与整合素等细胞表面受体结合,影...