盐反硝化枝芽孢杆菌(Virgibacillus halodenitrificans)是芽孢杆菌科中兼具“嗜盐”与“反硝化”双重技能的稀有物种。模式菌株 ATCC 49067 分离自法国太阳能盐场,可在 2–23 % NaCl、10–45 °C 范围内生长,更适盐度 3–7 %、pH 7.4–7.5,细胞壁含 meso-DAP,肽聚糖厚且膜脂分支,赋予其耐高渗与碱胁迫的能力。一、盐中反硝化该菌携带完整的 narG/napA-nirK-nor-nosZ 基因簇,能在 3–12 % 盐度下将 NO₃⁻ 依次还原为 N₂,并同步积累四氢嘧啶作为相容溶质,既完成脱氮又抵御渗透冲击。实验室摇瓶试验显示,盐度 8 % 时其对 NO₃⁻-N 去除率仍达 90 % 以上,N₂O 释放量低于检测限,为高盐废水生物脱氮提供了“零碳源”方案。二、油田与暗管应用菌株 WH-6 被制成“热-盐双耐”菌剂,在 55–80 °C、0.5–3.5 % NaCl 的采出水体系中,通过优先利用 NO₃⁻ 作电子受体,抑制硫酸盐还原菌活性,使 H₂S 产量下降 70 %,延长注水井管柱寿命。同时,含该菌的清淤剂与多孔沸石复配,用于盐碱地暗管排盐,一年后盐水收集率提高 35 %,出口浑浊度降至 4.7 mg L⁻¹,明显缓解因泥沙堵塞造成的维护难题。三、农业与生态修复在 1 % 盐度盆栽中,接种 10⁷ CFU g⁻¹ 土壤,可使生菜根际钾提高 20 %,硝酸盐含量下降 15 %,产量增 12 %。
YPG培养基(Yeast Extract-Peptone-Glucose Medium)是酵母提取物-蛋白胨-葡萄糖培养基的简称,堪称微生物实验室的“快餐”。配方极简:酵母粉5 g、蛋白胨10 g、葡萄糖20 g,补水至1 L,pH 6.2±0.2,无需调节即可满足大多数菌、酵母及部分细菌的快速增殖需求。酵母粉提供B族维生素和微量元素,蛋白胨供给多肽与氨基酸,葡萄糖以高碳浓度启动酵母发酵型代谢,短短12 h就能让酿酒酵母OD₆₀₀冲破1.0,是发酵工程与分子生物学过夜预培养的优先。若用于丝状菌,只需降低葡萄糖至10 g,并加入微量元素液,28 ℃静置2天,孢子产量可比PDA提高30%。YPG的另一优势是“可盐可甜”:补加15%甘油即成YPG/甘油,用于酵母感受态制备;添加2%琼脂便是YPG平板,蓝白斑筛选、转化子计数两不误。实验室里还流行“富氧版”——把葡萄糖提前115 ℃单独灭菌,避免美拉德反应,培养液颜色浅,下游HPLC检测有机酸无干扰。质量控制也轻松:高压后若颜色发黄,说明葡萄糖与氨基酸高温反应,可改用过滤除菌;室温保存1周仍澄清,即可继续使用。凭借组分明确、成本低廉、配制快速,YPG培养基已从传统酿酒实验室走向合成生物学、代谢工程与益生菌高密度发酵,成为微生物学家手中“养菌如泡茶”的经典底牌。异常威克汉姆酵母格雷厄姆氏根瘤菌是豆科家族里更“挑剔”的房客,却只认花生这一位房东。

球芽孢杆菌(Bacillus sphaericus)是芽孢杆菌属里的“圆球”,因细胞呈规整杆状、芽孢却近球形而得名。它广分布于土壤、淡水及蚊幼虫孳生水体,对碱性环境(pH 9–10)和高温(50 ℃)具有良好耐受性,是兼具环境治理与生物防治双重价值的稀有菌种。一、杀蚊利器球芽孢杆菌更被称道的是其对蚊幼虫的专一毒力。菌株2362在芽孢形成期同步产生二元素蛋白(BinA/BinB),被库蚊、按蚊幼虫摄食后,素在中肠结合受体,造成离子失衡、麻痹死亡,24 h致死率可达95 %以上,而对鱼类、哺乳动物几乎无害。WHO已将其列入“全球媒介生物防治推荐菌剂”,并制成可湿性粉剂或缓释颗粒,用于登革热、疟疾高发区的蚊媒控制,年撒施面积逾千万公顷。二、环境修复球芽孢杆菌还能分泌碱性蛋白酶和脂肪酶,在pH 10、45 ℃条件下仍保持80 %活性,可用于高碱含油废水处理。实验表明,向炼油废水中投加10⁷ CFU mL⁻¹菌液,7天COD去除率提升30 %,污泥量减少25 %,为高盐高碱工业废水提供低成本生物强化方案。三、农业应用菌株IAB-109对番茄青枯、辣椒疫霉具明显拮抗作用,抑菌带宽20 mm;同时产IAA 15 mg L⁻¹,盆栽玉米根长增28 %,产量提10 %。
拟近缘鞘孢菌(Chalara pseudoaffinis)是子囊菌门、盘菌亚纲、囊菌目下的丝状菌,更早在中国内蒙古阿尔山杜鹃湖湖水中被分离得到 。菌落灰白色,基质菌丝发达,可形成瓶梗式分生孢子器,产椭圆形分生孢子,需氧、耐低温,4 ℃仍可缓慢生长,适合作为冷链环境研究模型 。生态功能方面,该菌能分泌一系列细胞壁降解酶,可分解落叶与植物残体中的纤维素和半纤维素,促进有机质矿化,为水体微生物提供碳源 。初步试验表明,其培养滤液对灰霉、菌核等植物病原菌具有拮抗活性,抑菌圈直径15–20 mm,同时可产生几丁质酶,破坏线虫卵壳,盆栽试验使番茄根结线虫侵染率下降40 %,显示出开发低温生防制剂的潜力 。工业应用上,拟近缘鞘孢菌的低温酶系活性突出,10 ℃条件下纤维素酶和β-葡萄糖苷酶仍保持70 %以上活力,可用于冷链废弃物降解、低温洗涤或纸浆漂白,节能20 %并减少高温处理成本 。此外,其耐冷特性使其成为教学与科研中常用的“冷链模式菌”,高校常利用其进行低温生长、酶学及系统发育实验,安全等级为四类,操作简便 。菌体还可吸附Au³⁺、Cd²⁺,吸附量分别达50mg/g与35mg/g,为矿区重金属修复提供低成本方案。

堀越氏芽孢杆菌(Bacillus horikoshii)是20世纪90年代由日本科学家堀越等从碱性温泉沉积物中分离出的嗜碱菌,也是国际公认的模式菌株(ATCC 700161)[ ^82^ ][ ^84^ ]。菌体杆状、革兰氏阳性,可形成椭圆芽孢,更适pH 8.5–9.5、温度30–37 ℃,在Na₂CO₃浓度50 g L⁻¹的极端环境中仍能正常代谢,被称为“天然碱性细胞工厂”。一、耐碱机制基因组编码多拷贝Na⁺/H⁺逆向转运蛋白(mnh、nhaC)和碳酸酐酶,可将胞内多余Na⁺排出,并将CO₃²⁻转化为HCO₃⁻,维持胞内pH稳态;细胞壁肽聚糖含高比例二氨基庚二酸,增强膜稳定性,为高温高碱酶的高效表达提供平台。二、工业酶潜力其耐碱淀粉酶、普鲁兰酶更适pH 9–10,90 ℃半衰期>2 h,已用于淀粉糖化“一步法”,可省略传统工艺中的中和环节,节能15 %;耐碱蛋白酶在洗涤剂中可去除血渍、奶渍,低温活性优于市场同类酶20 %。三、农业与环境应用菌株P1具备“溶磷-钝化重金属”双重功能:在pH 9、Cd²⁺ 50 mg kg⁻¹条件下,仍可将难溶磷酸钙转化为磷277 mg kg⁻¹,同时胞外多糖吸附Cd²⁺,使水稻籽粒镉含量下降35 %,产量提高18 %。
其芽孢可耐沸水煮15分钟、紫外照射两小时,喷雾干燥存活率超过90%,为大规模制剂化提供了便利。异常威克汉姆酵母
BM液体培养基,全名Basal Mineral Liquid Medium,是微生物学界公认的“极简配方”。它只提供生命必需的矿物元素:K₂HPO₄ 1.0 g、KH₂PO₄ 1.0 g、MgSO₄·7H₂O 0.2 g、CaCl₂·2H₂O 0.02 g、Fe-EDTA 0.01 g,加蒸馏水至1 L,pH 6.5±0.1,无碳、无氮、无有机微量元素,因此也被称为“空白画布”。研究者可根据目标菌的代谢特点,精确添加单一碳源(如葡萄糖、苯甲酸、甲烷)、氮源(如NH₄Cl、NO₃⁻或尿素)及特定金属,实现代谢通路、降解基因或耐受机制的单变量研究。BM的高纯度与低背景使其成为环境微生物分离的优先。取河水或土壤浸提液,经0.22 μm过滤除菌后,取1 mL加入含BM的50 mL血清瓶,再投加目标污染物(如50 mg L⁻¹多环芳烃),28℃、150 r/min培养7天,即可富集到以该污染物为碳能源的降解菌群。继代3次后,稀释涂布于含BM的固体平板,菌落纯化率可达90%以上,极大减少杂菌干扰。此外,BM培养基在合成生物学中亦扮演重要角色。研究者可在BM中添加特定浓度的¹³C-葡萄糖或¹⁵N-NH₄Cl,实现全菌体同位素标记,为蛋白质组、代谢流分析提供干净背景;也可通过缺铁、缺锌的BM,研究金属调控蛋白的功能。异常威克汉姆酵母