慢病毒大规模纯化的捕获步骤包括：膜过滤澄清，随后切向流过滤/超滤或者体积排阻色谱浓缩。此外，需用核酸酶（benzonase或M-SAN HQ中盐核酸酶）来去除细胞残留的、质粒来源的DNA污染。这两个步骤顺序可以调整，依据项目工艺而定。两种工艺路线各有优缺点：先用核酸酶消化的优点是可去除大的DNA片段，且后续步骤可以去除残留核酸酶；但所用的核酸酶的量也非常大。与此相反，将核酸酶步骤后置的优点是大幅降低核酸酶的量(成本降低)；但后面的步骤必须有将核酸酶去除的能力。此外，后期用核酸酶的缺点是核酸污染可能会结合慢病毒颗粒形成沉淀，进而导致慢病毒在纯化中流失，从而影响得率。M-SAN HQ中盐核酸酶终产品放行检测包括microbe、Fungus及内毒检测等；四川生理盐条件中盐核酸酶
通过三质粒瞬转体系生产病毒载体，会引入宿主细胞DNA残留（HCD）、蛋白残留（HCP）、工艺杂质（如antibiotics、核酸酶等外源物质）等污染，存在潜在的致瘤性和免疫原性等风险。药品监管机构一般允许生物制品中存在10ng/dose以下的残留DNA。此外，根据杂质来源、工艺以及产品类型不同，也会对HCD限度做不同要求。为了达到这个要求，一般通过核酸酶处理和色谱联用的方法。一般在细胞培养液裂解/收获、澄清收获及超滤浓缩等环节加入核酸酶处理，需要工艺摸索来确认处理方式。陕西上海倍笃生物中盐核酸酶70950-150M-SAN HQ中盐核酸酶生产符合ISO 13485:2016规范，提供相关文件用于申报。
在生物工艺流程中，需要使用核酸酶去除终产品中的核酸污染，而核酸酶作为外源成份，也需要在生产流程中去除。核酸酶去除工艺包括热灭活法、酶抑制剂、离子交换和亲合层析法等。慢病毒LV的pI在6.0-6.5左右，包装了完整基因组DNA后的AAV病毒颗粒PI大致为5.9，来自于S.marcescens的全能核酸酶pI 6.85左右，M-SAN HQ中盐核酸酶pI 8.7左右。因此，在同样的条件下，从LV/AAV溶液中去除M-SAN HQ中盐核酸酶比去除Benzonase全能核酸酶更容易、更彻底。
ArcticZymes Technologies有两条产品线，分别针对分子诊断和生物药物生产两个领域。在分子诊断领域，产品有虾碱酶（SAP）、UNG酶、等温扩增酶（IsoPol）、连接酶、蛋白酶、内切核酸酶及外切核酸酶等，涉及核酸抽提、扩增及测序等应用。在生物药物生产领域，全球创新的盐活性核酸酶（Salt Active Nucleases, SANs)系列产品以其独特优势，在细胞基因药物及RNA药物生产中表现出更好的性能。其中，盐活性核酸酶SANs系列产品包含两款产品，分别是SAN HQ高盐核酸酶和M-SAN HQ中盐核酸酶；两款酶的差别在于发挥酶活的盐浓度范围分别是生理盐浓度范围和400-600mM高盐浓度范围。M-SAN HQ中盐核酸酶更适合细胞基因drug（如AAV、LVV、RV及OV等）的生产。
大多数研究级别的慢病毒是通过批次浓缩而不是粗制剂之后应用的，浓缩基本上是通过两步离心法产生的。在70000g通过超速离心浓缩后的慢病毒再通过蔗糖缓冲(50000g)纯化，然后溶解在配方缓冲液中。一种改进，特别是纯度方面的改进，基于离心/色谱联用的纯化方法。例如，Kutner等评估了组合纯化/浓缩方法。蔗糖缓冲的超速离心结合阴离子交换层析获得了88.2%的收率，而相反的组合则获得了77.6%的收率。在两种方法中，浓缩都超过了100倍，病毒滴度都超过了1010TU/ml(VSV-g包被的慢病毒)。US FDA指南要求：重组biologics终产品中，核酸杂质含量低于10ng/dose。河北中盐核酸酶70950-150
M-SAN HQ ELISA kit检测产品灵敏度高，定量范围为0.12-7.5ng/ml。四川生理盐条件中盐核酸酶
监管部门对HCD的残留量有明确的规定。美国FDA发布的指导原则中指出生物制品HCD残余限度为 100pg/剂，对于大剂量生物制品如单克隆抗体，根据其残留DNA来源及给药途径，残留量可放宽至 10ng/剂。细胞基因药物终产品的DNA残留有两种来源，分别是宿主细胞DNA（HCD）和转染用的质粒。质粒和HCD的存在形式不同，去除效率也差别很大。其中，质粒是裸露的DNA双链，带强负电荷，通过色谱纯化主要是离子交换能够很高效去除；HCD则是以核小体紧密折叠形成的染色质形式存在，几乎不以裸DNA形式存在，所以很难去除。四川生理盐条件中盐核酸酶
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