上海宿主细胞残留DNA检测常用知识

重组蛋白、抗体、疫苗、细胞与基因产品等生物制品大多来自生物工程细胞 ( 细菌、酵母、动物或人源细胞 ) 的复杂表达 / 生产系统，不同宿主的 rHCD 和 rHCR 不同，且存在不同片段长度和组成的复杂阵列，其风险须根据具体情况评估。各国药品监督管理机构对终产品中宿主细胞残留 DNA 的含量有着严格的限度控制，大多为不超过 10ng/ 剂或更低。湖州申科生物自主开发一系列宿主细胞残留 DNA荧光探针 qPCR 定量检测试剂盒，以及特定细胞系定制化试剂盒的开发、生产和测试，可满足不同宿主检测需求。

在宿主细胞残留 DNA 检测中，若回收率不合格，可按以下思路排查。先看 PCS/NCS，检查 PCS 回收率是否合格、计算公式是否正确，以及 NCS 质控是否合格 。接着排查试剂 / 耗材，确认洗涤液 B 是否过期或配制错误，异丙醇是否为分析纯，常温试剂有无结晶，试剂储存温度是否合适，磁珠是否难重悬 。再关注样品，了解样品残留量、加标量是否合适，pH 值是否异常，是否含抑制因子干扰磁珠作用和 PCR 实验 。以上排查完再审视操作过程，查看样品是否完全消化、消化后状态是否可流动，磁珠是否复温，洗涤 / 洗脱中磁珠状态、是否被误丢弃，洗脱前磁珠是否过干燥等 。

湖州申科生物的产品研发和制造过程按照 ISO13485 体系要求进行，参照CDE《生物制品质量控制分析方法验证技术审评一般原则》、《中国药典》9101分析方法验证指导原则和ICH Q2 (R2)：Guideline On Validation Of Analytical Procedures等对SHENTEK系列宿主细胞残留检测试剂盒进行了全面性能验证，包括线性、范围、准确性、定量限、精密度、耐用性、专属性等，符合法规要求。可提供试剂盒详细的验证报告，如果用户使用该验证报告，则只需进行针对样品的适用性验证即可（包括精密度实验和回收率实验）。

在宿主细胞残留 DNA 检测中，若出现扩增效率不合格情况，可按以下思路排查。先做数据分析，查看标曲线性图是否为正常 “S” 型扩增曲线，整体荧光信号是否偏低、复孔间信号有无交错，信号选择是否正常，有无离群点，程序设置是否正确 。接着进行耗材 / 设备排查，检查 EP 管等是否为无菌低吸附，移液器、PCR 设备是否在校验期，PCR 设备与 PCR 耗材是否匹配 。然后开展人员 / 试剂排查，确认是否只有某一操作员标曲异常，试剂储存有无误，是否从某一时间点起结果异常 。以上摸排后再进行操作排查，关注标曲稀释是否涡旋混匀及时间是否合适，取液时是否预润洗，移液速度，MIX 混匀及力度，上机前离心混匀情况，数据分析时基线、阈值线是否合适，ROX 矫正等操作细节 。

美国食品药品监督管理局（FDA）提醒使用HEK293T细胞生产病毒载体时因存在SV40 T抗原，还需要检测残留的腺病毒E1（E1A & E1B）和SV40 T抗原序列。《中国药典》有关生物制品宿主残留核酸质量控制要求和CDE颁布的《细胞***产品申请临床试验药学研究和申报资料的考虑要点》中关于质粒和病毒载体的质量标准也提到，如使用HEK293细胞进行病毒载体生产，需进行宿主细胞残留DNA检测和RNA残留、SV40大T抗原DNA残留、E1A和E1B基因DNA残留检测。

SHENTEK^®质粒 DNA 残留检测试剂盒用于定量检测基因治疗产品中质粒 DNA 残留的检测试剂盒，如 CAR-T 细胞中慢病毒载体制备相关的质粒 DNA。本试剂盒利用 Taqman 探针原理，通过各质粒共有 DNA 序列， 如ColE1/pMB1/pBR322/pUC 来源的复制子，定量检测样品中质粒 DNA 的残留。客户可以事先将质粒 DNA 序列给湖州申科生物技术人员进行确认。本试剂盒检测快速，专一性强，性能可靠，检测限可以达到 10² copies/μL。试剂盒配套有质粒DNA 定量参考品。本试剂盒与 SHENTEK^®宿主细胞残留 DNA 样本前处理试剂盒配套使用，可准确定量样品中残留的微量质粒 DNA。