草酸盐嗜氨菌

黏琼脂芽孢杆菌是2007年在深海沉积物里被“捞”出的新成员，因菌落能拉出长长琼脂糖丝，得了“黏琼脂”的绰号。它生活在低温、高压、寡营养的海底，靠分泌特殊β-琼脂糖酶，把坚硬的海藻碎片分解成单糖，再经乙酰-CoA途径合成能量，既填饱自己，也为周围菌群打开“粮仓”，成为深海碳循环的隐形枢纽。实验室更看重的是它的“冷酶工厂”。其琼脂糖酶更适温度只25℃，在4℃仍保持60%活性，比陆源同类酶省电一半；若把粗酶液直接喷到石花菜浆里，40分钟就能让胶体黏度降80%，滤出的寡糖可作益生元、化妆品保湿剂，甚至用于微胶囊壁材。更妙的是，菌体在贫氮环境会自发形成厚壁芽孢，可耐55℃、紫外照射两小时，喷雾干燥存活率仍超90%，给工业化降低了冷链与包被成本。国内团队已把黏琼脂芽孢杆菌制成灰粉末，用于即食凉粉、果冻的低温脱胶，使生产周期从12小时缩到3小时，耗水减少四成；残渣富含寡糖，可作饲料添加剂，提高仔猪日增重5%。未来，科学家计划把耐冷酶基因转进枯草芽孢杆菌，让“冷酶”在常温海洋里就地降解漂浮海藻，为蓝碳保护再添一把微生物钥匙。小小黏琼脂芽孢杆菌，用一缕黏丝，把千米深海的秘密缝进人类绿色的产业链。牙龈卟啉单胞菌的脂多糖（LPS）具有广的生物学活性，被认为是革兰氏阴性菌的主要毒力因子之一。草酸盐嗜氨菌

赫氏埃希氏菌是深海热液口的“化学魔术师”，能在摄氏百度、千倍大气压的暗夜里，把硫化氢当早餐，把二氧化碳当点心来款待。它用氢硫还氧酶把剧毒硫化氢拆成电子与质子，驱动ATP合酶高速旋转，合成能量，再借逆三羧酸循环把无机碳织成有机糖，无需阳光，也能养活整片“黑烟囱”丛林。科学家搭乘深潜器采集菌体，发现其细胞膜含特殊醚键脂质，像给自身裹上耐高温的陶瓷瓦，蛋白质内部也布满离子键，仿佛微型钢铁骨架，才让它在沸水中依旧柔韧。实验室里，研究团队把它的固碳基因簇移植到工业大肠杆菌，使后者能在废气流里自养生长，产出的聚羟基脂肪酸酯可制可降解塑料，为碳中和提供新思路。小小赫氏埃希氏菌，用肉眼看不见的臂膀，托住地球深部与未来的绿色循环。翘鳞伞小小威氏芽孢杆菌，用微米之躯守护绿色丰收，让农药瓶少一个，饭碗多一粒。

PS培养基（Peptococcus Broth），又名消化球菌肉汤，是专为厌氧革兰阳性球菌——消化球菌属（Peptococcus）及消化链球菌（Peptostreptococcus）等严苛厌氧菌设计的富营养液体培养基。关键配方含胰酪蛋白胨15 g、酵母粉5 g、葡萄糖5 g、L-半胱氨酸0.5 g、NaCl 5 g，补水至1 L，pH 7.2±0.1。L-半胱氨酸兼具还原与硫源，可瞬间降低氧化还原电位至-200 mV，无需额外预还原，即开即用；葡萄糖提供可发酵碳源，使菌体在6 h内进入对数期，12 h活菌数可达10⁹ CFU/mL，满足快速扩增需求。临床检验中，PS培养基常被用于厌氧菌血培养增菌：将5 mL静脉血直接注入含PS的真空厌氧瓶，35℃静置培养48 h，若瓶底出现絮状沉淀、培养液混浊并伴酸臭，即提示可能存在消化球菌或厌氧链球菌沾染；结合MALDI-TOF质谱，可在72 h内完成种水平鉴定，比传统厌氧平板法缩短2天。科研领域，PS肉汤亦是研究厌氧菌铁代谢、短链脂肪酸产量的优先平台：只需在基础液中去除葡萄糖，换用可溶性淀粉或乳酸钠，即可考察不同碳源对丁酸、己酸合成路径的影响；若添加0.1 %血红素，更能启动厌氧呼吸链，使细胞干重提升30%。质量控制方面，PS培养基灭菌后应呈浅黄色透明，若氧化变粉，需弃用。

格雷厄姆氏根瘤菌是豆科家族里更“挑剔”的房客，却只认花生这一位房东。它自带“门禁卡”——特殊的Nod因子，能精细识别花生根毛分泌的染料木苷，两者对接成功，根毛便卷曲成螺旋，把菌请进“地下别墅”。随后，细菌释放信号，诱导根部细胞分裂，三天鼓出乳白根瘤，像给根系挂上微型氮肥厂。瘤内氧气被植物合成的豆血红蛋白调到纳摩级，固氮酶安全开工，将空气中惰性的N₂转化为NH₄⁺，昼夜输送给花生，亩产蛋白因此提升三成，农户少施20公斤尿素，却多收一筐饱满果仁。更妙的是，收获后根瘤遗落田间，氮素缓慢释放，后茬小麦吸氮量提高15%，土壤硝态淋失减少四成，地下水不再“又咸又绿”。如今，科研团队把菌液做成铝箔袋装，拌种即可，比化肥便宜三成，却无污染；还植入耐旱基因，让它在华北旱地也能结瘤。小小格雷厄姆氏根瘤菌，用微米之躯撬动绿色农业，让蓝天少一缕烟，田里多一季香。其IAA产量达118mg/L，明显高于同属菌株，可刺激小麦根长增加35%，干重提高28%。

嗜碳芽孢杆菌（Bacillus carboniphilus）是芽孢杆菌属里少见的“高碳”。菌体杆状、革兰氏阳性，可形成椭圆芽孢，更适温度 45–50 ℃，pH 7.0–8.5，可在高浓度可溶性淀粉、糖蜜或木质纤维素水解液中快速生长，因而得名“碳爱好者”。一、高效利用碳源菌株 ATCC 700101 携带多拷贝 α-淀粉酶、普鲁兰酶和木聚糖酶基因，48 h 内可将 15 % 淀粉液化糖化至还原糖 180 g L⁻¹，转化率 > 90 %，为浓醪发酵提供廉价糖源；与酵母共培养，乙醇产量提 12 %，蒸馏能耗降 8 %。二、高渗耐受胞内积累相容溶质四氢嘧啶，使菌体在糖浓度 300 g L⁻¹、渗透压 1.8 MPa 下仍保持 80 % 活性；芽孢耐 80 ℃ 30 min，便于浓糖液灭菌后直投，缩短发酵周期 12 h。三、农业应用菌株 BC-20 产 IAA 20 mg L⁻¹ 并溶磷 2.9 mg L⁻¹，玉米盆栽根长增 28 %，吸磷量提 22 %；与秸秆复配堆肥，堆温 24 h 升至 65 ℃，纤维素降解率提高 30 %，堆肥周期缩短 7 d，杀灭病原菌和杂草种子效果明显。四、工业酶潜力其耐热耐碱普鲁兰酶更适 pH 9、65 ℃，已用于淀粉糖化“一步法”，节省中和酸 20 %；木聚糖酶在 pH 10、60 ℃仍保持 85 % 活性，用于纸浆漂白，氯用量减少 30 %，降低可吸附有机卤化物（AOX）排放。用长赖氨酸芽孢杆菌菌液灌根，番茄根结线虫侵染率下降42%，果实Vc含量提高12%，产量增8.3%。暗褐色毛霉

利用CRISPR-Cas9技术激起玫瑰链孢囊菌中的沉默基因簇，可以发现并生产新的抗生物质，如Auroramycin 。草酸盐嗜氨菌

德氏乳杆菌德氏亚种（Lactobacillus delbrueckii subsp. delbrueckii）是乳酸菌家族中更早被分离命名的“元老”之一，1901年即进入科学视野。菌体短杆、无芽孢、不运动，专性发酵葡萄糖产乳酸，更适生长温度42～45℃，可在pH 3.5的酸环境中存活，耐高温却畏冷，4℃即停止繁殖。基因组只1.8 Mb，代谢途径精简，却拥有完整的乳酸脱氢酶与寡肽转运系统，使其在蛋白质丰富的基质中快速产酸，抑制菌。工业上，它是酸奶、瑞士奶酪与保加利亚传统发酵乳的关键菌种，与嗜热链球菌协同可将牛乳在3小时内酸化至pH 4.2，形成细腻凝乳与特征性乙醛风味；同时分泌胞外多糖，赋予产品顺滑口感并延缓后酸化。近年研究还发现，其表面蛋白SlpA能黏附肠道上皮，诱导IL-10分泌，缓解小鼠结肠炎；热灭活菌体亦可通过启动树突细胞TLR2信号，增强肠道IgA应答，兼具益生与免疫调节潜力。随着合成生物学兴起，德氏乳杆菌德氏亚种被工程化改造为“活药工厂”，可在肠道内持续释放胰岛素样肽或白细胞介素，为糖尿病与炎症性肠病提供新型微生态治疗方案。草酸盐嗜氨菌