尼氏芽孢杆菌(Bacillus niacini)是一类革兰氏阳性、产芽孢的杆状细菌,属于芽孢杆菌属(Bacillus)。该菌以其独特的烟酸(维生素B₃)代谢特性、的植物促生能力和在可持续农业中的广泛应用而著称,是开发微生物肥料和生物农药的重要菌种资源。分类地位与形态特征尼氏芽孢杆菌呈直杆状,大小约为0.6-1.0×2.0-5.0 μm,具周生鞭毛,运动活泼。其更明显的形态特征是能够形成椭圆形中生芽孢,芽孢囊不膨大,革兰氏染色阳性。菌落形态为圆形、边缘不规则、表面干燥皱褶,呈乳白色至淡黄色。该菌为兼性厌氧菌,更适生长温度为30-37℃,更适pH为6.5-7.5,具有广盐性,可在0-7% NaCl浓度范围内生长,显示出良好的环境适应能力。烟酸代谢与生理功能该菌的命名源于其独特的烟酸代谢特性。烟酸是NAD⁺和NADP⁺的前体,在细胞能量代谢和氧化还原反应中发挥关键作用。尼氏芽孢杆菌能够高效合成和利用烟酸,部分菌株甚至能够以烟酸作为只有碳源生长。这一代谢特征与其强大的抗氧化胁迫能力密切相关,使其能够在植物根际等氧化还原波动剧烈的环境中定殖存活。此外,该代谢途径还影响其芽孢形成效率和抗逆性,保障其在不利环境条件下的长期存活。分生孢子梗直立,不分枝或只偶尔分枝,表面常具1至多个瘤状分隔。盲肠肠球菌
菌生轮枝孢(Verticillium fungicola),又名菌轮枝霉、马氏轮枝菌(V. malthousei),是丝孢纲轮枝菌属的重要植物病原菌。这种微生物是食用菌栽培业相当有破坏性的病原菌之一,主要侵染双孢蘑菇,引起严重的褐斑病(又称干泡病),给全球蘑菇产业造成重大经济损失。形态上,菌生轮枝孢具有轮枝菌属的典型特征。其分生孢子梗直立,具隔膜,顶端呈独特的轮状分枝,通常有2-4层辐射状轮生枝梗,每轮具3-4个小梗。分生孢子呈卵形或卵圆形,透明无色,单细胞,大小约2-10×1-2微米,常聚集成小簇附着于小梗顶端,偶有形成孢子球的现象。此外,该菌还能产生小分生孢子和厚壁的微菌核,这些休眠结构使其在土壤中具有极强的存活能力。在病害识别上,菌生轮枝孢与同属的蘑菇轮枝菌(V. psalliotae)常会混淆。二者的关键区别在于分生孢子形态:菌生轮枝孢的分生孢子为卵形或卵圆形,而蘑菇轮枝孢的分生孢子则呈明显的新月形(弯孢),且常与小梗垂直排列。该菌的致病机制主要通过侵染蘑菇菌丝体,阻碍子实体正常发育。受沾染的蘑菇出现褐色病斑,质地干硬,形成典型的"干泡"症状,严重时导致绝收。其分生孢子通过空气、水源、土壤和昆虫传播,一旦在菇房定殖便难以根除。云南刺盘孢科学家把Cry基因导入棉花、水稻,培育的Bt作物毕生自带抗虫盾,减少农药喷洒七成以上 。

不规则分枝发簇孢(Sporothrix inusitatiramosa)是中国菌学家在神农架地区发现的一个菌新种,由中国科学院微生物研究所孔华忠于1991年正式发表,为发簇孢属增添了一个具有独特形态特征的成员。形态上,该菌更明显的特征是其分生孢子梗呈不规则分枝状,这正是其中文名称"不规则分枝"的由来。作为无性型菌,其在PDA培养基上25-28℃培养时,形成白色、疏松且扩展旺盛的菌落,质地棉絮状。分生孢子呈淡色,这是发簇孢属的典型特征之一,但与其他已发表的种相比,其孢子梗分枝模式具有明显差异,构成了分类学上的重要鉴别依据。生态习性方面,不规则分枝发簇孢分离自湖北省神农架更高级自然保护区的腐木上。神农架作为北半球中纬度地区保存完好的亚热带森林生态系统,为腐生菌提供了丰富的栖息环境。该菌作为木材腐朽菌,在森林物质循环中扮演分解者角色,参与木质纤维素的降解过程。分类学上,不规则分枝发簇孢的发现在1991年《菌学报》上报道后,为发簇孢属(Sporothrix)的物种多样性研究提供了新资料。该属菌广分布于土壤、植物残体和木材中,部分种类具有重要的生态功能或医学意义。
在白杨锯屑的木质纤维素基质中,一种兼具固氮潜力与纤维素降解能力的革兰氏阴性细菌悄然发挥着双重生态功能——解纤维素根瘤菌(Rhizobium cellulosilyticum),又称解纤维素根瘤杆菌。这名字中的"解纤维素"三字,精细描述了其突破传统根瘤菌代谢特征的独特能力,而"根瘤菌"则指向其属于根瘤菌属(Rhizobium)的分类地位,是该属中较早被证实具有纤维素降解能力的模式物种。 解纤维素根瘤菌隶属于细菌域、变形菌门(Proteobacteria)、α-变形菌纲、根瘤菌目(Rhizobiales)、根瘤菌科(Rhizobiaceae)。该菌由García-Fraile等人于2007年从西班牙萨拉曼卡的白杨(Populus alba)锯屑中分离鉴定,模式菌株为DSM 18291(= CIP 108443 = LMG 23590),16S rRNA基因序列登录号为DQ855276。作为模式菌株(type strain),它是根瘤菌属分类界定和系统发育研究的重要基准材料。 在形态特征上,解纤维素根瘤菌为革兰氏阴性杆菌,细胞呈杆状,大小0.5-0.9×1.2-3.0微米,具极生或周生鞭毛,能运动。在YMA培养基上30℃培养时,菌落呈圆形、黄色、不透明,表面光滑,边缘整齐,直径2-3毫米。该菌好氧,氧化酶和接触酶阳性,更适生长温度30℃,更适pH 7.0。与传统根瘤菌不同,该菌能够水解纤维素,、内层包被则质地坚韧,厚约2毫米,呈栓皮质或皮革质,颜色为黑褐色。

浅珊瑚色北极杆菌(Arcticibacterium pallidicorallinum)是一类从北极海洋环境中分离获得的革兰氏阴性细菌,属于黄杆菌科(Flavobacteriaceae)。该菌以其独特的浅珊瑚色菌落、的低温适应能力和丰富的多糖代谢特性而著称,是研究极地微生物多样性和开发冷适应生物技术的宝贵资源。分类地位与形态特征浅珊瑚色北极杆菌呈杆状或略弯曲,大小约为0.4-0.6×1.0-3.0 μm,无芽孢,具周生鞭毛,运动活泼。其更明显的形态特征是形成特征性的浅珊瑚色至粉红色菌落,这源于其胞内积累的类胡萝卜素(如玉米黄质、紫黄质)等色素,这些色素不仅赋予其独特的外观,更是其抵抗极地强紫外辐射和氧化胁迫的重要保护机制。该菌为严格好氧的化能异养菌,更适生长温度为15-20℃(生长温度范围0-28℃),更适pH为7.0-8.0,需Na⁺离子维持生长,属于典型的嗜冷耐盐海洋细菌。极地环境适应策略北极海域具有常年低温、季节性海冰覆盖、营养盐脉冲式输入等极端特征。浅珊瑚色北极杆菌进化出多重冷适应机制:其细胞膜富含不饱和脂肪酸(如二十碳五烯酸EPA)和支链脂肪酸,维持低温下的膜流动性;基因组编码多种冷休克蛋白(Csp)和冷适应酶,保障转录翻译和代谢活动在低温下高效进行。当环境中存在线虫时,菌丝特化形成具短柄的球形粘性细胞,这些粘性球通过表面的粘性物质粘附线虫。长衫假交替单胞菌
该菌在我国分布较广,山东、中国台湾等地均有记录,常生长于阴湿的山地阔叶林中。盲肠肠球菌
解硫胺素解硫胺素芽孢杆菌(Aneurinibacillus aneurinilyticus)是一类革兰氏阳性、产芽孢的杆状细菌,属于解硫胺素芽孢杆菌属(Aneurinibacillus)。该菌以其对硫胺素(维生素B₁)的特殊代谢需求或分解能力而著称,是研究细菌维生素代谢和开发生物技术的独特微生物资源。分类地位与形态特征解硫胺素解硫胺素芽孢杆菌呈直杆状,大小约为0.5-1.0×2.0-5.0 μm,具周生鞭毛,运动活泼。其更明显的形态特征是能够形成椭圆形中生芽孢,芽孢囊稍膨大,革兰氏染色阳性。菌落形态为圆形、边缘整齐、表面湿润光滑,呈乳白色至淡黄色。该菌为好氧或兼性厌氧菌,更适生长温度为30-37℃,更适pH为6.5-7.5,具有中等程度的耐盐性,可在含0-5% NaCl的培养基中生长。硫胺素代谢特性该菌的命名源于其独特的硫胺素代谢特性。硫胺素焦磷酸(TPP)是细胞代谢中关键的辅酶,参与糖代谢、支链氨基酸合成和磷酸戊糖途径等重要反应。解硫胺素解硫胺素芽孢杆菌具有分解硫胺素的能力,能够分泌硫胺素酶(thiaminase),催化硫胺素水解为嘧啶和噻唑两部分,导致维生素B₁失活。这一特性使其在特定生态环境中可能与其他生物存在营养竞争关系,同时也为研究硫胺素代谢调控提供了模式材料。盲肠肠球菌